조세심판원 심판청구 법인세

연구 및 인력개발비 세액공제는 최저한세 적용대상이 아닌 외국인 투자에 대한 법인세 감면보다 우선 적용됨

사건번호 조심-2010-중-2314 선고일 2011.06.14

최저한세의 적용을 받지 아니하는 외국인투자에 대한 법인세 감면을 최저한세 적용대상인 연구 및 인력개발비 세액공제보다 우선하여 적용하여야 한다는 주장은 받아들이기 어렵다고 판단됨

주 문

OO세무서장이 2010.3.22. 청구법인에게 한 2004사업연도 법인세 643,382,060원의 부과처분은 증빙불비가산세 230,273,465원을 차감하여 그 세액을 경정하고, 나머지 심판청구는 기각한다.

1. 처분개요
  • 가. 청구법인은 OOOOOOOOO OOOOOOOOOOOOO OOOOOOOOOOO(이하 “미국 모기업”이라 한다)이 100% 출자하여 1998.12.28. 설립된 외국인투자기업으로서 전력용 반도체 제조 및 판매 등의 사업을 영위하여 왔으며, 2002 및 2004․2005사업연도에조세특례제한법제121조의4의 외국인투자에 대한 법인세 감면을 먼저 적용하고 이전 사업연도로부터 이월된 같은 법 제10조의 연구 및 인력개발비에 대한 세액공제를 나중에 적용하여 법인세를 신고하였다.
  • 나. 중부지방국세청장은 청구법인에 대한 법인제세 통합조사를 거쳐 최저한세를 적용받는 연구 및 인력개발비 세액공제를 최저한세 적용대상이 아닌 외국인투자 법인세 감면보다 우선 적용하여야 하므로, 다음 <표1>과 같이 2004․2005사업연도로 이월된 연구 및 인력개발비 세액공제는 2002사업연도에 모두 공제받아 소멸되었고, 청구법인이 2004사업연도에 국제복합운송업체인 OOOOOO 주식회사(이하 “OOOOOO”이라 한다), 주식회사 OOOOOOOO(OO OOOOOOOOO”라 한다)로부터 실제 화주로서 국제복합운송용역을 제공받고 미국 모기업이 이들 운송업체에게 지급한 운송비 11,513,673,264원을 미국 모기업에게 송금하였음에도 이에 대하여 영세율세금계산서를 수취하지 아니하여법인세법제76조 제5항에 따른 증빙불비가산세 적용대상(가산세 금액 230,273,465원, 2%)이며, 그 밖에 매출채권 지연회수에 따른 인정이자를 익금에 산입하여야 한다는 과세자료를 처분청에 통보하였다. <표1> 세액공제 적용관련 신고 및 경정내역 (OO O O) * 경정내용에는 매출채권 지연회수 관련 인정이자가 포함되어 있어 산출세액이 2004사업연도 30,157,949,114원, 2005사업연도 9,872,597,895원으로 증가하였으나, 세액공제가 이월적용되지 아니하고 세액감면만 29,948,393,009원 및 9,600,167,072원이 적용됨에 따라 관련세액만큼 납부세액이 증가함
  • 다. 처분청은 위 과세자료에 따라 2010.3.22. 청구법인에게 2004사업연도 법인세 643,382,060원(증빙불비가산세 230,273,465원 포함) 및 2005사업연도 법인세 539,019,090원을 경정․고지하였다.
  • 라. 청구법인은 이에 불복하여 2010.6.17. 심판청구를 제기하였다.

2. 청구법인 주장 및 처분청 의견

  • 가. 청구법인 주장

(1) 외국인투자에 대한 법인세 감면은 다른 조세지원에 우선하여 적용하는 특례로서법인세법제59조 제1항에서 세액감면이 세액공제에 우선하여 적용하도록 명백하게 규정하고 있고, 법인세법, 조세특례제한법 등 다른 법률에서 그 적용순서에 관하여 달리 규정하지 아니하고 있음에도 연구 및 인력개발비 세액공제를 외국인 투자 세액감면에 우선하여 적용함은 법적근거가 없는 부당한 처분이다.

(2) 청구법인의 미국 모기업은 다음 <표2>와 같이 운송비 절감 및 효율적 관리를 위해 국내법인인 OOOOOO 및 미국법인인 OOO OOOOOOO OOOO와 국제복합화물운송에 대한 연간 포괄운송계약(Master Service Agreement)을 체결하였고, 이에 따라 청구법인은 화주로서 수출 등을 하면서 OOOOOO O OOOOOOOO가 제공하는 운송 용역을 이용하였으며, 관련 운송료는 계약의 당사자인 미국 모기업이 OOOOOO 및 미국법인인 OOO OOOOOOO OOOO에 지급하였으며, 청구 법인은 미국 모기업에게 운송과 관련하여 경영관리비용을 지급하여 왔다. <표2> 화물운송 개요 (가) (주위적 청구) 미국 모기업이 운송계약을 맺어 외국 및 국내운송회사를 거쳐 청구법인의 화물을 운송한 것으로 청구법인은 국내 운송회사와의 직접적인 계약당사자가 아니고, 자세한 공급시기 및 거래가액을 미국 모기업만 알고 있을 뿐 청구법인은 관련 내용을 알 수 없어 세금계산서를 교부받을 수 없는 실정이며, 최초 운송인인 국내 운송회사는 그 명의로 송장을 발부하였으나 국제복합운송용역에 대한 모든 책임을 부담하는 것이 아니고, 실제 운송인인 외국 항공운송회사와 연대책임 등을 부담하는 것이며, 미국 모기업의 주관 하에 운송경비 절감 및 효율적 관리를 위해 국제복합운송서비스를 이용하고, 모기업에게 공통경비 배부액 형식으로 운송비를 지급하였으며, 2005~2008사업연도에 발생한 동일한 내용의 운송비에 대한 과세전적부심사(중부지방국세청 2010중과0085, 2010.7.8.)에서 청구법인의 주장을 채택하여 증빙불비가산세 부과대상으로 보지 아니하는 결정을 하였음에도, 청구법인이 국내 운송회사로부터 직접 영세율 세금계산서를 수취․보관하지 아니하였다 하여 2004사업연도 발생분에 대하여 증빙불비가산세를 부과함은 부당하다. (나) (예비적 청구) 처분청 의견대로 단순한 국내거래로 볼 경우에도 OOOOOO은 타인 소유의 항공기를 이용하는 반면, OOOOOOOO는 자사 또는 본사 소유의 항공기를 이용하여 부가가치세법 시행령제25조 제1항의 외국항행용역을 제공하였으므로, 이에 대하여는 같은 법 시행령 제57조 제1항 제3호에 따라 세금계산서 교부의무가 면제되고, 법인세법 시행규칙79조 제9호의3에 따라 증빙수취의무가 없으므로 OOOOOO과의 거래분에 한하여 증빙불비가산세를 부과하여야 하며, 이 경우에도 OOOOOO은 국내에서 청구법인으로부터 화물을 인수하여 항공기에 선적한 후 외국 항공운송회사의 항공기를 이용하여 국제복합운송용역을 제공한 것이어서 화주로부터 수취한 운임에서 외국 항공운송회사에게 지급한 운임을 차감한 나머지 운송주선수수료만 부가가치세 과세표준이 되므로, 관련 증빙불비가산세는 운송주선수수료에 상당하는 금액을 기초로 산정하여 감액되어야 한다.

  • 나. 처분청 의견

(1) 법인세법제60조 제2항 및 같은 법 시행령 제97조 제3항의 위임에 따라 제정된 같은 법 시행규칙 별지 제3호 서식에서 각 사업연도 소득에 대한 법인세를 계산함에 있어 최저한세 적용대상인 공제감면세액을 먼저 적용하고, 그 다음에 최저한세 적용대상이 아닌 공제감면세액을 적용하도록 하고 있는바, 이는 법인세법제59조 제1항 각호에서 정하는 순위와는 다른 별도의 규정이 있는 경우에 해당하므로, 외국인투자에 대한 법인세 감면을 우선 적용하고 이월공제가 가능한 연구 및 인력개발비 세액공제를 나중에 적용하여야 한다는 청구법인의 주장은 이유없다.

(2) OOOOOO O OOOOOOOO는 청구법인의 수입 및 수출과 관련된 물품을 운송하는 국내업체로서 청구법인의 모회사인 미국 모기업과 연간 국제복합운송계약을 맺고, 화주인 청구법인으로부터 화물을 인수하여 자기명의로 항공화물운송장 등을 발급하며, 타인의 화물기를 이용하여 화물을 운송하고 미국 모기업으로부터 운임을 수령하며, 미국 모기업은 관련 송장을 청구법인에게 발행하여 운송업체에게 지급한 동일금액을 재청구하고, 청구법인은 물류내역과 대조하여 분기별로 미국 모기업에게 송금하여 최종적으로 운송비를 부담하여 왔다. (가) 미국 모기업은 화물운송에 있어 형식상의 계약주체일 뿐 실제 화주인 청구법인이 실질적으로 국제복합운송계약을 체결하고 관련 용역을 제공받은 것으로 보아야 하고, 청구법인이 미국 모기업에 지급한 운송비는 공통경비의 배분이 아니라 화주인 청구법인이 제품수출과 관련하여 발생한 운송비용을 직접 부담한 것이며, 청구법인이 OOOOOOOO 등으로부터 운송용역을 제공받는 즉시 운송비 명세서 등의 증빙을 요청하여 당연히 보관하여야 하고 청구법인의 운송비 부담내역도 운송관련 전산시스템(Trendset)에 의해 확인이 가능하여 영세율 세금계산서를 교부받을 수 있었음에도 이를 해태하였으므로 증빙불비가산세를 부과함은 정당하다. (나) 법인세법 시행규칙제79조 제9호의3에 의한 항공기의 항행용역은 자가 항공용역을 의미하는 것으로 OOOOOOOO는 자가 항공기를 보유한 미국 모법인과는 다른 별도의 국내법인이어서 자가 항공용역을 제공하였다고 볼 수 없으므로, OOOOOOOO가 공급한 운송용역은 지출증빙수취의무가 면제되는 외국항행용역에 해당하지 아니하고, 국제복합운송주선업을 영위하는 사업자가 자기명의로 항공화물운송장 등을 발급하고 국제복합운송계약에 의하여 자기 계산과 책임하에 화물을 운송하고 대가를 받는 경우에는, 다른 운송업자에게 의뢰하여 화물이 운송되더라도 출발지에서 도착지까지의 운송비 전액에 대하여 영세율 세금계산서를 교부하여야 하는 것이므로, 국내에서의 운송주선수수료만을 대상으로 증빙불비가산세를 부과하여야 한다는 청구주장은 타당하지 아니하다.

3. 심리 및 판단
  • 가. 쟁점

① 최저한세 적용대상인 이월된 연구 및 인력개발비 세액공제와 최저한세 적용대상이 아닌 외국인 투자에 대한 법인세 감면이 동시에 적용되는 경우 적용 순위

② 미국 모기업을 통해 국내운송회사를 이용하여 화물을 운송하고 미국 모기업에게 대가를 지급한 경우 영세율 세금계산서를 증빙으로 갖추어야 하는지 여부

  • 나. 관련법률

(1) 쟁점① 관련

○ 법인세법(2003.12.30. 법률 제7005호로 개정된 것) 제59조【감면 및 세액공제액의 계산】

① 이 법 및 다른 법률의 적용에 있어서 법인세의 감면에 관한 규정과 세액공제에 관한 규정이 동시에 적용되는 경우 그 적용순위는 별도의 규정이 있는 경우를 제외하고는 다음 각호에 의한다. 이 경우 제1호 및 제2호의 금액을 합한 금액이 법인이 납부할 법인세액(토지 등 양도소득에 대한 법인세 및 가산세를 제외한다)을 초과하는 경우에는 그 초과하는 금액은 이를 없는 것으로 본다.

1. 각 사업연도의 소득에 대한 세액감면(면제를 포함한다)

2. 이월공제가 인정되지 아니하는 세액공제

3. 이월공제가 인정되는 세액공제. 이 경우 당해 사업연도 중에 발생한 세액공제액과 이월된 미공제액이 함께 있는 때에는 이월된 미공제액을 먼저 공제한다.

4. 제58조의3의 규정에 의한 세액공제. 이 경우 당해 세액공제액과 이월된 미공제액이 함께 있는 때에는 이월된 미공제액을 먼저 공제한다.

○ 법인세법(2003.12.30. 법률 제7005호로 개정된 것) 제60조【과세표준 등의 신고】

① 납세의무있는 내국법인은 각 사업연도의 종료일부터 3월 이내에 대통령령이 정하는 바에 따라 당해 사업연도의 소득에 대한 법인세의 과세표준과 세액을 납세지 관할세무서장에게 신고하여야 한다.

② 제1항의 규정에 의한 신고에 있어서는 그 신고서에 다음 각호의 서류를 첨부하여야 한다.

2. 대통령령이 정하는 바에 따라 작성한 세무조정계산서(이하 “세무조정계산서”라 한다)

○ 법인세법 시행령(2003.12.30. 대통령령 제18174호로 개정된 것) 제97조【과세표준의 신고】

③ 법 제60조 제2항 제2호의 규정에 의한 세무조정계산서는 재정경제부령이 정하는 법인세 과세표준 및 세액조정계산서로 한다.

○ 법인세법 시행규칙(2004.3.5. 재정경제부령 제356호로 개정된 것) 제82조【서식】

① 법인세 및 법인세에 부가되는 농어촌특별세의 신고 및 납부에 관한 서식은 다음 각호와 같다. (후단 생략)

3. 영 제97조 제3항의 규정에 의한 별지 제3호 서식의 법인세 과세표준 및 세액조정계산서 [별지 제3호 서식]: 법인세 과세표준 및 세액조정계산서

④ 납 부 할 세 액 계 산 󰒑󰒜󰒤 산 출 세 액 (󰒑󰒜󰒤 = 󰒑󰒛󰒭) 󰒑󰒜󰒥 공 제 감 면 세 액 (ㄱ) 17 󰒑󰒜󰒦 차 감 세 액 18 󰒑󰒜󰒧 공 제 감 면 세 액 (ㄴ) 19 󰒑󰒜󰒨 가 산 세 액 20 󰒑󰒜󰒩 가감계(󰒑󰒜󰒦 - 󰒑󰒜󰒧 + 󰒑󰒜󰒨) 21 ※ 작성요령 󰒑󰒜󰒥 공제감면세액㈀: 공제감면세액 및 추가납부세액합계표(갑)[별지 제8호 서식(갑)]의 󰒑󰒡󰒤 합계란의 금액(최저한세 적용대상 공제감면세액) 기재 󰒑󰒜󰒧 공제감면세액㈁: 공제감면세액 및 기납부세액합계표(갑)[별지 제8호 서식(갑)]의 󰒑󰒜󰒤 합계란의 금액(최저한세 적용제외 공제감면세액) 기재

○ 조세특례제한법(2003.12.30. 법률 제7003호로 개정된 것) 제10조【연구 및 인력개발비에 대한 세액공제】

① 내국인(괄호 생략)이 2006년 12월 31일 이전에 종료하는 과세연도까지 각 과세연도에 연구 및 인력개발을 위한 비용 중 대통령령이 정하는 비용(이하 “연구 및 인력개발비”라 한다)이 있는 경우에는 다음 각호의 방법 중 하나를 선택하여 세액공제를 적용받을 수 있다. (이하 생략)

○ 조세특례제한법 제121조의2【외국인투자에 대한 법인세 등의 감면】

① 다음 각호의 1에 해당하는 사업을 영위하기 위한 외국인투자(외국인투자촉진법 제2조 제1항 제4호 의 규정에 의한 외국인투자를 말한다. 이하 이 장에서 같다)로서 대통령령이 정하는 기준에 해당하는 외국인투자에 대하여는 제2항 내지 제5항 및 제12항에 규정하는 바에 따라 법인세ㆍ소득세ㆍ취득세ㆍ등록세ㆍ재산세 및 종합토지세를 각각 감면한다. (이하 생략)

○ 조세특례제한법 제121조의4【증자의 조세감면】

① 외국인투자기업이 증자하는 경우에 당해 증자분에 대한 조세감면에 대하여는 제121조의2 및 제121조의3의 규정을 준용한다. (단서 생략)

○ 조세특례제한법 제132조【최저한세】

① 내국법인(괄호 생략)의 각 사업연도의 소득과법인세법제91조 제1항의 규정을 적용받는 외국법인의 각 사업연도의 국내원천소득에 대한 법인세(법인세법 제55조의2 의 규정에 의한 토지 등 양도소득에 대한 법인세ㆍ가산세 및 대통령령이 정하는 추징세액을 제외하며, 대통령령이 정하는 세액공제 등을 하지 아니한 법인세를 말한다)를 계산함에 있어서 다음 각호의 1에 규정된 감면 등을 적용받은 후의 세액이 제1호 및 제2호의 규정에 의한 손금산입 및 소득공제 등을 하지 아니한 경우의 과세표준(제1호의 규정에 의한 준비금을 관계규정에 의하여 익금에 산입한 금액을 포함한다)에 100분의 15(중소기업의 경우에는 100분의 10)를 곱하여 계산한 세액에 미달하는 경우 그 미달하는 세액에 상당하는 부분에 대하여는 감면 등을 하지 아니한다.

1. 제4조, 제8조의2, 제9조, 제17조,제28조, 제30조, 제55조, 제55조의2 제1항, 제75조,제104조의3, 법률 제4806호조세감면규제법중 개정법률 부칙 제11조, 법률 제4666호조세감면규제법개정법률 부칙 제14조, 법률 제4285호조세감면규제법중 개정법률 부칙 제22조 및 법률 제3865호조세감면규제법중 개정법률 부칙 제14조의 규정에 의하여 각 사업연도의 소득금액계산에 있어서 손금으로 산입하는 특별감가상각비 및 준비금

2. 제13조, 제14조,제49조, 제55조, 제55조의2 제4항, 제60조 제2항, 제61조 제3항,제63조의2 제5항, 법률 제4666호조세감면규제법개정법률 부칙 제15조 및 법률 제5584호조세감면규제법개정법률 부칙 제12조 제3항의 규정에 의한 소득공제금액ㆍ익금불산입금액 및 비과세금액

3. 제5조, 제7조의2, 제10조(중소기업이 아닌 자의 당해 과세연도 세액공제대상금액에서 대통령령이 정하는 석사 및 박사의 인건비로 발생한 금액이 차지하는 비율을 곱하여 산출한 금액을 차감한 금액에 한한다. 이하 이 조에서 같다), 제10조의2,제11조, 제12조 제2항, 제24조 내지 제26조, 제31조 제6항, 제32조 제4항,제94조, 법률 제4666호조세감면규제법개정법률 부칙 제14조, 법률 제3865호조세감면규제법중 개정법률 부칙 제14조 및 법률 제5584호조세감면규제법개정법률 부칙 제12조 제2항(종전 제37조의 개정규정에 한한다)의 규정에 의한 세액공제금액

4. 제6조, 제7조, 제12조 제1항,제21조, 제31조 제4항ㆍ제5항, 제32조 제4항, 제63조, 제64조,제68조, 제102조, 법률 제4806호조세감면규제법중 개정법률 부칙 제14조, 법률 제4666호조세감면규제법개정법률 부칙 제13조 및 제16조와 법률 제5584호조세감면규제법개정법률 부칙 제11조 및 제12조 제2항(종전 제35조의 개정규정에 한한다)ㆍ제4항의 규정에 의한 법인세의 면제 및 감면

③ 제1항 및 제2항의 규정에 의한 최저한세의 적용에 관하여 필요한 사항은 대통령령으로 정한다.

○ 조세특례제한법 제144조【세액공제액의 이월공제】

① 제5조, 제7조의2, 제10조 내지 제11조, 제12조 제2항, 제24조 내지 제26조,제94조, 제104조의8 및 법률 제5584호조세감면규제법개정법률 부칙 제12조 제2항(종전 제37조의 개정규정에 한한다)의 규정에 의하여 공제할 세액 중 당해 과세연도에 납부할 세액이 없거나 제132조의 규정에 의한 최저한세의 적용으로 공제받지 못한 부분에 상당하는 금액은 당해 과세연도의 다음 과세연도의 개시일부터 5년 이내에 종료하는 각 과세연도에 이월하여 그 이월된 각 과세연도의 소득세(사업소득에 대한 소득세에 한한다) 또는 법인세에서 이를 공제한다.

② 각 과세연도의 소득세 또는 법인세에서 공제할 금액으로서 제5조, 제7조의2, 제10조 내지 제11조, 제12조 제2항,제24조 내지 제26조, 제94조, 제104조의8 및 법률 제5584호조세감면규제법개정법률 부칙 제12조 제2항(종전 제37조의 개정규정에 한한다)의 규정에 의하여 공제할 금액과 제1항의 규정에 의하여 이월된 미공제금액이 중복되는 경우에는 제1항의 규정에 의하여 이월된 미공제금액을 먼저 공제하고 그 이월된 미공제금액간에 중복되는 경우에는 먼저 발생한 것부터 순차로 공제한다.

○ 조세특례제한법 시행령(2003.12.30. 대통령령 제18176호로 개정된 것) 제126조【최저한세】

② 법 제132조 제1항 본문에서 “대통령령이 정하는 세액공제 등”이라 함은 법인세 감면 중 동조 동항 제3호 및 제4호에 열거되지 아니한 세액공제ㆍ세액면제 및 감면을 말한다.

(2) 쟁점② 관련

○ 법인세법(2003.12.30. 법률 제7005호로 개정된 것) 제76조【가산세】

⑤ 납세지 관할세무서장은 법인(대통령령이 정하는 법인을 제외한다)이 사업과 관련하여 대통령령이 정하는 사업자로부터 재화 또는 용역을 공급받고 제116조 제2항 각호의 1에 규정하는 증빙서류를 수취하지 아니한 경우에는 동항 단서의 규정을 적용받는 경우를 제외하고는 그 수취하지 아니한 금액의 100분의 2에 상당하는 금액을 가산한 금액을 법인세로서 징수하여야 한다. 이 경우 산출세액이 없는 경우에도 가산세는 징수한다.

○ 법인세법(2003.12.30. 법률 제7005호로 개정된 것) 제116조【지출증빙서류의 수취 및 보관】

② 제1항의 경우에 법인이 대통령령이 정하는 사업자로부터 재화 또는 용역을 공급받고 그 대가를 지급하는 경우에는 다음 각호의 1에 해당하는 증빙서류를 수취하여 이를 보관하여야 한다. 다만, 대통령령이 정하는 경우에는 그러하지 아니하다.

2. 부가가치세법제16조의 규정에 의한 세금계산서

○ 법인세법 시행령(2003.12.30. 대통령령 제18174호로 개정된 것) 제158조【지출증빙서류의 수취 및 보관】

① 법 제116조 제2항에서 “대통령령이 정하는 사업자”라 함은 다음 각호의 1에 해당하는 사업자를 말한다.

1. 법인. 다만, 다음 각목의 1에 해당하는 법인을 제외한다.

  • 라. 국내사업장이 없는 외국법인

② 법 제116조 제2항 단서에서 “대통령령이 정하는 경우”라 함은 다음 각호의 1에 해당하는 경우를 말한다.

1. 공급받은 재화 또는 용역의 건당 거래금액(부가가치세를 포함한다)이 5만원 이하인 경우

2. 농ㆍ어민(한국표준산업분류에 의한 농업 중 작물생산업ㆍ축산업ㆍ복합농업, 임업 또는 어업에 종사하는 자를 말하며,법인을 제외한다)으로부터 재화 또는 용역을 직접 공급받은 경우

3. 소득세법제127조 제1항 제3호에 규정된 원천징수대상 사업소득자로부터 용역을 공급받은 경우(원천징수한 것에 한한다)

4. 기타 재정경제부령이 정하는 경우

○ 법인세법 시행규칙 (2004.3.5. 재정경제부령 제356호로 개정된 것) 제79조【지출증빙서류의 수취 특례】 영 제158조 제2항 제4호에서 “기타 재정경제부령이 정하는 경우”라 함은 다음 각호의 경우를 말한다. 9의3. 항공기의 항행용역을 제공받은 경우

○ 부가가치세법 제11조 【영세율 적용】

① 다음 각호의 재화 또는 용역의 공급에 대하여는 영의 세율을 적용한다.

3. 선박 또는 항공기의 외국항행용역

4. 제1호 내지 제3호 이외에 외화를 획득하는 재화 또는 용역으로서 대통령령이 정하는 것

○ 부가가치세법 제16조 【세금계산서】

① 납세의무자로 등록한 사업자가 재화 또는 용역을 공급하는 때에는 제9조에 규정하는 시기에 다음 각호의 사항을 기재한 계산서(이하 “세금계산서”라 한다)를 대통령령이 정하는 바에 의하여 공급을 받는 자에게 교부하여야 한다. (단서 및 각호 생략)

④ 대통령령이 정하는 경우에는 제1항의 규정을 적용하지 아니할 수 있다.

○ 부가가치세법 시행령 제25조 【외국항행용역의 범위】

① 법 제11조 제1항 제3호에 규정하는 외국항행용역은 선박 또는 항공기에 의하여 여객이나 화물을 국내에서 국외로, 국외에서 국내로 또는 국외에서 국외로 수송하는 것을 말하며, 외국여행사업자가 자기의 사업에 부수하여 행하는 재화 또는 용역의 공급으로서 다음 각호에 규정하는 것을 포함한다.

1. 다른 외국항행사업자가 운용하는 선박 또는 항공기의 탑승권을 판매하거나 화물운송계약을 체결하는 것

② 운송주선업자가 국제복합운송계약에 의하여 화주로부터 화물을 인수하고 자기책임과 계산하에 타인의 선박 또는 항공기 등의 운송수단을 이용하여 화물을 운송하고 화주로부터 운임을 받는 국제운송용역과 항공법에 의한 상업서류송달용역은 제1항의 규정에 의한 외국항행용역에 포함된다.

○ 부가가치세법 시행령 제57조 【세금계산서 교부의무의 면제 등】

① 법 제16조 제4항에 규정하는 대통령령이 정하는 경우는 다음 각호에 규정하는 재화 또는 용역을 공급하는 경우로 한다.

3. 법 제11조 제1항 제1호(괄호 생략)ㆍ제2호 및 제3호(공급받는 자가 국내에 사업장이 없는 비거주자 또는 외국법인인 경우와 제25조 제1항의 규정에 의한 외국항행용역으로서 항공기의 외국항행용역 및 항공법에 의한 상업서류송달용역에 한한다)에 규정하는 재화 또는 용역

  • 다. 사실관계 및 판단

(1) 먼저 쟁점(1)에 본다. (가) 쟁점주택 양도당시(2006.12.29.) 청구인과 동일세대원은 홍OO (처), 정OO(장모), 김OOOOOO(자)으로 청구인은 2000.2.7. 경매로 취득한 OOOOO OOOO OOO OO-OOO 단독주택 을 보유하고 있는 것으로 확인되며, 정OO 역시 경매로 취득한 쟁점외주택을 보유하고 있는 것으로 나타난다. (나) 주민등록정보에 의하여 청구인과 정OO는 각각 2005.5.31.과 2005.11.7. 쟁점외주택에 전입하여 쟁점주택 양도 당시에는 쟁점외주택에 동일 세대를 구성한 것으로 확인되며, 쟁점주택 양도 전후 청구인과 정OO의 주민등록 내역은 아래 <표1>과 같이 확인된다. OOOOOOOOOO OOOO OOOO OOOO OO (다) 처분청은 청구인이 쟁점주택 양도 당시(2006.12.29.) 정OO가 주민등록상 쟁점외주택에 동일세대를 구성한 사실이 주민등록정보에 의하여 확인되며, 청구인이 쟁점외주택이 아닌 다른 곳에 거주하였다면 거주증빙이 있을 것임에도 이를 제출하지 못하고 있으므로, 주민등록정보에 의하여 확인된 바에 따라 쟁점주택 양도당시 청구인 세대가 1세대 3주택을 보유하고 있었던 것으로 보아 중과세율을 적용하여 아래 <표2>와 같이 양도소득세를 결정․고지하였다. OOOOOOOOOO OOOOO OOOO (라) 이에 대하여 청구인은 장모 정OO가 실질적으로는 장인소유의 OOOO OOOO OOO-OO 단독주택에 거주하였으나, 당시 장인의 경제적 사정이 여의치 아니하여 장모 정OO 소유의 쟁점외주택을 담보로 대출받는 과정에서, 세입자가 있는 경우 대출금액이 적다고 하여 쟁점외주택으로 정경자의 주소를 옮겼고 때마침 청구인의 전세만료기간과 맞아 청구인으로 하여금 거주하도록 하였으나, 결국 청구인의 세대도 세입자라 하여 쟁점외주택을 담보로 대출을 받지 못하게 되자 별 생각없이 주소이전을 하지 아니하였던 것이며, 정OO는 OOOOO OOOO OOO OOO-OO OOOOO OOO-OOO(OOO 명의의 집, 2007.11.20. 이OO에 양도), OOOOO OOOO OOO OOO-O OOOOO OO-OOO, OOOOO OO OOO OO-OOO에서 거주하였으며, 쟁점외주택에서는 거주하지 아니하였다고 주장하고 있다. (마) 아울러, 관련증빙으로 제출한 교회성도 조OO 등의 확인서의 내용은 아래 <표3>과 같으며, 2008년 OO교회(OOOOO OOOO OOO OOO) 요람을 제출하였는 바, 요람상 정OO의 주소는 OOOOOO OOOO OOOO OOO OOO OOOOO로 기재되어 있다. OOOOOOOOOO OOO OOOO (바) 이상의 사실관계 등을 종합하여 살피건대, 청구인은 쟁점주택 양도 당시 정OO가 쟁점외주택에 거주하지 아니하고 실제로 OOOOO OOOO OOO OOO-OO OOOOO OOO-OOO에 거주하였다고 주장하나, 거주사실을 객관적으로 증명할 수 있는 증빙없이 사인간에 작성가능한 사실확인서 및 청구인 본인이 작성․제출된 확인서만으로는 청구인이 쟁점외주택에 거주하였다고 볼 수 없으며, 추가 제출한 2008년 OO교회 요람에 청구인의 주소가 OOOOOO OOOO OOOO OOO OOO OOOOO로 기재되어 있으나 이는 쟁점주택 양도후 1년이상 경과된 시점의 증빙으로 이 역시 객관적인 증빙이 될 수 있다고는 보여지지 아니하므로 청구주장을 받아들이기 어려운 것으로 보인다.

(2) 쟁점(2)에 대하여 본다. (가) 청구인은 쟁점주택이 건축한지 약 30년된 노후 주택으로 인테리어업을 하는 홍OO(처남)에게 부탁하여 원가수준에서 벽체공사 및 냉․난방 공사 등을 하였고, 처남매부지간이라 별도의 견적서 및 계약서 등을 작성하지 아니하였는 바, 동 공사비 등 자본적지출금액인 쟁점금액에 대한 증빙으로 보관하고 있던 세금계산서를 제출하였다고 주장하고 있다. (나) 그러나 처분청의 심리자료에 의하면 청구인의 처남 홍OO가 위 공사를 한 후 쟁점주택이 2006.12.29. 주식회사 OOOOOOOOO(대표 홍OO, 청구인의 장인)에 양도되었다가 2007.12.7. 김OO에게 양도되었는 바, 양수자 김OO이 쟁점주택의 상태가 리모델링 공사를 했다고 볼 수 없고 오히려 쟁점주택을 취득한 후 본인이 벽체 및 보일러 공사를 시행하였다고 진술한 점, 쟁점금액에 대한 증빙으로 세금계산서외에 금융거래내역․견적서․공사계약서 등 별도 증빙을 제출하지 못하고 있는 점, 이 건 심판청구시 제출한 세금계산서(공급자: OOOOOOO)와 항변자료 제출시 제출한 세금계산서(공급자: OO건축, 2006.11.1. OO건축에서 OOOOOOO로 상호 변경)가 다르고 OOOOOOO의 2006년 제2기 매출신고시 쟁점금액에 대한 매출신고 내역이 없는 점 등을 종합하여 볼 때, 청구주장을 받아들이기 어려운 것으로 판단된다.

4. 결 론

이 건 심판청구는 심리결과 청구주장이 일부 이유 있으므로국세기본법제81조, 제65조 제1항 제2호 및 제3호에 의하여 주문과 같이 결정한다.

결정 내용은 붙임과 같습니다.

원본 출처 (국세법령정보시스템)