간이과세포기신고 없이 일반과세자로 부가세 신고한 경우의 재고납부세액부과 여부

심판청구번호 국심1999서 0666(1999. 9. 8) 95.2.12 ○○○시 ○○○구 ○○○동 ○○○(○○○빌딩, 이하 "쟁점사업장"이라 한다)를 사업장으로 하여 부동산 임대업을 하기 위해 일반과세자로 사업자등록을 하고 상가건물을 신축한 후 부동산임대업을 영위하여 1996.4.1부터 부동산 임대수입금액에 대하여 일반과세자로 부가가치세 신고를 한 사실이 있다. 처분청은 청구인의 부동산 임대업 최초 과세기간인 1996년 제1기(1996.4.1∼1996.6.30)의 공급대가가 간이과세자에 해당함에도 법정기한내에 간이과세포기 신청을 하지 아니하였기 때문에 1997년 제1기부터 간이과세자로 유형전환된 것으로 보아 1998.10.15 청구인에게 1997년 제1기 과세기간 부가가치세 43,711,420원(재고납부세액)을 결정·고지하였다. 청구인은 이에 불복하여 1998.11.25 심사청구를 거쳐 1999.3.22 이 건 심판청구를 하였다.

2. 청구인 주장 및 국세청장 의견

• 가. 청구인 주장 처분청은 청구인에게 일반과세자용 사업자등록증을 발급하여 주었고, 간이과세자로서의 사업자등록증을 정정하여 주지도 아니하였으며, 일반사업자로서의 과세표준에 의하여 1997년 제1기 예정, 제2기 예정, 1998년 제1기 예정 고지까지 하여 청구인을 일반사업자라고 공적인 견해표시를 하였고, 청구인도 이를 신뢰하여 왔는데도 처분청은 청구인이 1997.1.1부터 일반과세자에서 간이과세자로 유형전환된 것으로 보아 쟁점부동산을 신축하면서 공제받은 재고납부세액에 대하여 부가가치세를 과세한 이 건 처분은 부당하므로 취소하여야 한다. 청구인의 경우 신규사업자로서 최초 과세기간인 1996년 제1기 부가가치세 과세표준이 간이과세자에 해당되어 1997.1.1부터 간이과세자로 유형이 전환됨이 부가가치세법시행령 제74조 의 2 제1항에 규정되어 있으나, 간이과세자로 유형이 전환되기 20일까지 처분청은 청구인에게 일반과세자에서 간이과세자로 전환된다는 내용을 통보하여야 하고, 사업자등록증을 정정하여 교부하도록 부가가치세법 시행령 제74조 의 2 제2항에 규정되어 있다. 따라서 일반과세자로 신고하였던 부가가치세 신고사실 등에 대하여 아무런 시정 조치없이 간이과세포기신고서를 법정기한내에 제출하지 아니하였다는 이유만으로 간이과세자로 사업자등록을 직권 정정하고 재고납부세액을 경정하여 고지한 이 건 과세처분은 국세기본법 제15조 에 규정한 신의 성실의 원칙에 위배되므로 취소하여야 한다.
• 나. 국세청장 의견 간이과세자로 적용하게 되는 때에는 1역년의 공급대가가 150백만원에 미달되는 경우이며 신규로 사업을 개시한 개인사업자는 최초의 과세기간에 대한 확정신고 후 개시하는 과세기간부터 간이과세자 적용하도록 규정하고 있어 청구인의 경우 간이과세포기신고서를 제출하지 아니하였고, 간이과세전환시 감가상각자산의 신고 및 재고납부세액을 납부하지 아니하였으므로 처분청이 재고납부세액을 추징한 것은 잘못이 없다. 또한 청구인은 간이과세자로 전환될 때 통지도 없었고 일반사업자로 계속하여 받아들여진 지금에 와서 소급하여 유형전환시켜 재고납부세액을 부과함은 신의성실의 원칙에 위배된다고 하나, 과세유형전환통지에 대한 규정이 강제되어 있지 아니하므로 과세유형의 전환사실을 통지하지 아니하고 정정된 사업자등록증을 교부하지 아니한 채 부가가치세를 과세하였다하여 이를 위법하다 할 수는 없는 것이어서 이 건의 경우 신의성실의 원칙을 적용할 수는 없다.

• 가. 쟁점 이 건은 일반과세자로 사업자등록을 하고 부동산임대업을 영위하는 청구인의 1역년의 공급대가가 간이과세자에 해당한다하여 처분청이 청구인을 간이과세자로 유형을 전환하고 재고납부세액을 부과한 처분이 신의성실원칙에 위배되는지 여부를 가리는 데 그 다툼이 있다.
• 나. 관계법령 (1) 부가가치세법 제25조 【간이과세 및 과세특례】제1항에서 『다음 각 호의 1에 해당하는 개인사업자에 대하여는 제4장 내지 제6장의 규정에 불구하고 이 장의 규정에 의하여 부가가치세를 부과징수한다. 다만, 대통령령이 정하는 사업을 제외한다.

1. 직전 1역년의 재화와 용역의 공급에 대한 부가가치세가 포함된 대가(이하 "공급대가"라 한다)가 1억 5천만원에 미달하는 개인사업자로서 제2호의 규정에 해당하지 아니하는 자(이하 "간이과세자"라 한다)

2. 직전 1역년의 공급대가가 대통령령이 정하는 금액에 미달하는 개인사업자(이하 "과세특례자"라 한다)』라고 규정하고 있고, 같은 조 제2항에서 『직전년 또는 직전과세기간에 신규로 사업을 개시한 개인사업자에 대하여는 그 사업개시일부터 그 과세기간종료일까지의 공급대가의 합계액을 12월로 환산한 금액을 기준으로 하여 제1항의 규정을 적용한다. 이 경우에 1월 미만의 단수가 있는 때에는 이를 1월로 한다.』라고 규정하고 있으며, 부가가치세법 제30조 【간이과세 또는 과세특례 포기】제1항에서 『간이과세자 또는 과세특례자가 일반과세자에 관한 규정을 적용받고자 하는 경우에는 제25조의 제1항의 규정에 불구하고 제4장 내지 제6장의 규정을 적용받을 수 있다. 이 경우 그 적용을 받고자 하는 달의 전달 20일까지 대통령령이 정하는 바에 따라 사업장관할세무서장에게 신고하여야 한다.』라고 규정하고 있다. (2) 부가가치세법시행령 제74조 【간이과세 및 과세특례의 범위】제2항에서 『법 제25조 제1항 단서에서 "대통령령이 정하는 사업"이라 함은 다음 각 호의 사업을 말한다.

1. 간이과세자에 관한 규정의 적용이 배제되는 사업

• 가. 광업
• 나. 제조업. 다만, 주로 최종 소비자에게 직접 재화를 공급하는 사업으로서 총리령이 정하는 것을 제외한다.
• 다. 도매업(소매업을 겸영하는 경우를 포함한다)
• 라. 부동산매매업』이라고 규정하고 있고, 같은법시행령 제74조의 2【간이과세·과세특례 및 일반과세의 적용시기】제1항에서 『법 제25조의 규정에 의하여 간이과세자 또는 과세특례자에 관한 규정이 적용되거나 적용되지 아니하게 되는 기간은 1역년의 공급대가가 법 제25조 제1항 제1호 또는 제74조 제1항 각 호에서 규정하는 금액에 미달하거나 그 이상이 되는 해의 다음 해의 제2과세기간으로부터 그 다음 해의 제1과세기간까지로 한다. 다만, 신규로 사업을 개시한 경우에는 최초의 과세기간에 대한 확정신고 후 개시하는 과세기간부터 기산한다.』라고 규정하고 있으며, 같은 조 제2항에서 『제1항의 경우에 당해 사업자의 관할세무서장은 법 제25조의 규정에 의하여 간이과세자 또는 과세특례자에 관한 규정이 적용되거나 적용되지 아니하게 되는 과세기간 개시 20일 전까지 그 사실을 통지하여야 하며, 사업자등록증을 정정하여 과세기간개시 전일까지 교부하여야 한다』라고 규정하고 있고, 같은 조 제3항에서 『제1항에 규정한 시기에 법 제25조의 규정에 의하여 간이과세자 또는 과세특례자에 관한 규정이 적용되는 사업자에 대하여는 제2항의 규정에 의한 통지에 관계없이 제1항에 규정한 시기에 법 제25조의 규정에 의하여 간이과세자 또는 과세특례자에 관한 규정을 적용하며, 제1항에 규정한 시기에 법 제25조의 규정이 적용되지 아니하는 사업자에 대하여는 제1항의 규정에 불구하고 제2항의 규정에 의한 통지를 받은 날이 속하는 과세기간까지는 법 제25조의 규정 의하여 간이과세자 또는 과세특례자에 관한 규정을 적용한다.』라고 규정되어 있다. (3) 국세기본법 제15조 에서 『납세자가 그 의무를 이행함에 있어서는 신의에 좇아 성실히 하여야 한다. 세무공무원이 그 직무를 수행함에 있어서도 또한 같다.』라고 규정하고 있다.
• 다. 사실 및 판단 이 건 처분이 신의성실원칙에 위배되는지 여부를 본다. 첫째, 청구인의 경우 최초 과세기간인 1996년 제1기의 공급대가가 12,246,441원으로서 이를 1역년으로 환산한 과세표준이 53,884,340원이 되어 간이과세자에 해당되며, 간이과세포기신고를 하지 아니하였으므로 청구인은 부가가치세법 제30조 제1항 및 같은법 시행령 제74조의 2 규정에 따라 97년 제1기부터 자동적으로 과세특례자로 과세유형이 전환되었다. 둘째, 처분청은 청구인이 1996년 제1기 확정신고부터 1997년 제2기 확정신고까지 일반과세자로 신고한 것을 수리한 사실이 있으나, 과세관청이 사업자로부터 부가가치세의 예정신고나 확정신고를 받은 행위만으로는 간이과세자 규정의 적용을 배제할 수 없는 것(대법원 94부10719, 94.12.2 같은 뜻임)이고, 따라서 과세관청이 부가가치세의 신고를 받은 행위만으로 과세관청이 일반과세자로서의 부가가치세 과세에 관하여 공적인 견해를 표명한 것으로 볼 수 없다. 셋째, 간이과세자가 일반과세자로 전환되는 경우와는 달리 일반과세자에게 간이과세자로 전환되는 경우 과세유형전환 사실의 통지에 관계없이 간이과세자로 과세할 수 있도록 규정하고 간이과세자가 간이과세자 규정의 적용을 받지 않고 일반과세자 규정의 적용을 받기 위하여는 간이과세자 포기 신고를 하여야 하므로 간이과세의 포기신고를 함이 없이 일반과세자로 부가가치세 신고를 한 사실과 처분청이 간이과세자로 납세고지를 한 사실만으로는 이 건의 경우 간이과세 규정의 적용을 배제할 수 없다.
• 라. 결론 따라서 이 건 심판청구는 청구인의 주장이 이유없다고 인정되므로 국세기본법 제81조 및 제65조 제1항 제2호의 규정에 의하여 주문과 같이 결정한다.