쟁점세금계산서를 사실과 다른 세금계산서로 보아 쟁점매입세액을 불공제한 처분이 정당한지 여부(취소)

[참조결정] 국심1994경1541

[주 문] 분 부가가치세 39,800,000원의 부과처분은 이를 취소한다.

[이 유]

1. 처분개요 청구인은 경기도 용인군 기흥읍 OO리 OOOOO에 사업장을 두고 OO산업이라는 상호로 씽크대 제조업을 운영하는 자로서 93.8.18 경기도 송탄시 OO동 OOO 소재 공장신축공사(이하 “쟁점공사”라 한다)도급계약을 서울특별시 서대문구 OO로 OO OOO에 사업장을 둔 OO건설주식회사(93.10.9 서울특별시 은평구 OO동 OOO로 사업장을 이전하였으며 이하 “청구외법인”이라 한다)와 350,000,000원(부가가치세 별도)에 체결하고 93.9.17 130,000,000원, 93.10.21 100,000,000원, 93.11.30 120,000,000원 합계 350,000,000원의 세금계산서(이하 “쟁점세금계산서”라 한다)를 청구외법인으로부터 교부받아 35,000,000원의 매입세액(이하 “쟁점매입세액”이라 한다)을 공제하고 93년 제2기 부가가치세를 신고납부하였다. 처분청은 위 청구외법인이 건설업면허대여업체로 93.12.17 건설업면허가 취소되었으므로 쟁점세금계산서는 그 기재내용이 사실과 다르다고 보아 쟁점매입세액을 불공제하고 93년 제2기분 부가가치세 39,800,000원을 95.6.16 청구인에게 결정고지하였다. 청구인은 이에 불복하여 95.8.11 심사청구를 거쳐 95.11.2 심판청구를 제기하였다.

2. 청구주장 및 국세청장 의견

• 가. 청구 주장 청구인은 93.8.18 쟁점공사 도급계약 체결시 청구외법인에게 사업자등록증, 건설업면허증, 법인등기부등본등을 징구하여 일반적으로 요구되는 주의의무를 다하였고, 청구외법인에게 공사대금을 무통장입금을 통하여 지급한 선의의 거래당사자이기 때문에 쟁점세금계산서에 의하여 쟁점매입세액을 공제해 주어야 한다.
• 나. 국세청장 의견 면허대여업체의 금융거래의 흐름은 건축주가 면허대여업체에 무통장 입금시키면 면허대여업체가 이를 인출하여 면허대여수수료를 공제하고 실시공자에게 지급하는 것이 관례로 되어있는바, 쟁점공사대금이 청구외법인에 입금된 사실에만 의거하여 청구외법인이 쟁점공사를 하였다고 볼 수 없으므로 처분청이 쟁점세금계산서를 사실과 다른 세금계산서로 보아 쟁점매입세액을 불공제한 처분은 잘못이 없다.

3. 심리 및 판단

• 가. 쟁점 이건 심판청구의 다툼은 쟁점세금계산서를 사실과 다른 세금계산서로 보아 쟁점매입세액을 불공제한 처분의 당부를 가리는데 있다.
• 나. 관계법령 부가가치세법 제17조 제1항은 사업자가 정부에 납부하여야 할 부가가치세액(이하 “납부세액”이라 함)은 자기가 공급한 재화 또는 용역에 대한 세액(이하 “매출세액”이라 함)에서 자기의 사업을 위하여 사용되었거나 사용될 재화 또는 용역의 공급에 대한 세액(이하 “매입세액”이라 함)을 공제한 금액으로 한다고 규정하면서 같은조 제2항에서는 교부받은 세금계산서의 내용이 사실과 다른 경우의 매입세액은 매출세액에서 공제하지 아니하도록 규정하고 있다.
• 다. 판단

(1) 이건 사실관계를 살펴보면 청구인은 청구외법인과 93.8.18 쟁점공사 도급계약을 체결한 후인 93.12.17 청구외법인이 건설업면허대여를 이유로 건설업면허가 취소되었고(건설부공고 1993-214호), 이로부터 6개월여 후인 94.6.30 청구외법인을 관할하는 서부세무서장에 의하여 사업자등록이 직권말소되었다. 이와 관련하여 처분청은 청구외법인의 건설업면허가 취소되었음을 이유로 쟁점세금계산서를 사실과 다른 세금계산서로 보아 쟁점매입세액을 불공제하였으나, 사업자가 거래상대방의 사업자등록증을 확인하고 거래에 따른 세금계산서를 교부하거나 교부받은 경우, 거래상대방이 관계기관의 조사로 인하여 명의위장사업자로 판정되었다 하더라도 당해 사업자를 선의의 거래당사자로 볼 수 있는 때에는 경정 또는 조세범처벌법등에 의한 불이익한 처분을 받지 아니한다고 할 것이다.(기본통칙 6-2-1...21, 국심94경1541, 94.10.22등 다수, 같은뜻임),

(2) 청구인은 쟁점공사가 청구외법인에 의하여 수행되었고 청구인은 선의의 거래당사자라는 거증으로 ① OOOO은행 OO동지점이 발행한 기성고확인 조서 및 청구외법인에게 공사대금이 입금된 무통장입금표, ② 청구외법인이 쟁점공사의 하자담보를 위하여 OOOO보험(주)와 체결한 보험계약의 이행(하자)보증보험증권, ③ 93.8.18 쟁점공사 도급계약 체결당시 청구외법인에게 징구하였다는 사업자등록증, 법인등기부등본, 건설업면허증, 납세완납증명서, 쟁점공사내역서등을 당심판소에 제출하고 있는바, 이에 대하여 살펴본다. 청구인이 청구외법인에게 공사대금을 지급한 내역을 보면 공사대금 385,000,000원(부가가치세 포함)중 200,000,000원은 청구인이 OOOO은행으로부터 대출받은 OOOO시설자금으로 93.9.27 70,000,000원, 93.10.23 60,000,000원, 93.11.30 40,000,000원, 94.2.8 25,000,000원, 94.4.13 5,000,000원이 각각 OOOO은행 OO동지점의 기성고확인을 거쳐 청구외법인의 OOOO은행통장(계좌번호 OOOOOOOOOOOOOOOOOO)에 입금된 것이 무통장입금표에 의하여 확인되고 있고 처분청도 실지조사를 통하여 이러한 사실을 인정하고 있으며, 나머지 185,000,000원의 지급사실도 청구외법인이 발행하고 OOOO은행 OO동지점이 보관하고 있는 입금표에 의하여 확인되는 점으로 보아 청구외법인이 이건 쟁점공사를 한 것으로 보인다. 또한, 청구외법인이 쟁점공사에 따른 하자담보를 위하여 OOOO보험(주)와 보험계약을 체결하고 동 OOOO보험(주)로부터 94.2.7 교부받은 이행(하자)보증보험증권에 의하면 쟁점공사의 하자가 발생할 경우 11,500,000원의 보험금을 피보험자인 청구인에게 지급하게 되어있고 보험계약기간은 공장신축일인 93.12.19부터 94.12.18까지 12개월로 하고 있는바, 공사를 직접 수행하지 아니한 공급자가 이러한 보험계약을 체결하였다고 보기는 어렵다는 점에 비추어 보더라도 청구외법인이 쟁점공사를 하였다고 봄이 상당할 것이다. 더욱이 이건 쟁점공사의 도급계약은 청구외법인이 건설업면허대여를 이유로 건설업면허가 취소된 93.12.17로부터 3개월전이고, 관할 서부세무서장에 의하여 사업자등록이 직권말소된 94.6.30로부터는 10개월전인 93.8.18 체결되었으며, 청구인이 계약체결 당시 전시 사업자등록증, 법인등기부등본, 건설업면허증, 납세완납증명서등 거래상대방을 확인할 수 있는 자료를 징구한 것이 인정되는 점으로 보아 청구인은 일반적으로 요구되는 주의의무를 다한 선의의 거래당사자라고 할 것이다.

(3) 위와같은 점등을 종합하여 볼때, 청구인은 선의의 거래당사자로 사실과 부합하는 세금계산서를 교부받은 것으로 보이며, 처분청이 단순히 청구외법인의 건설업면허가 취소되었다는 이유로 쟁점세금계산서를 그 내용이 사실과 다른 세금계산서라고 보아 쟁점매입세액을 불공제한 처분은 부당하다고 하겠다.

• 라. 이건 심판청구는 청구주장이 이유있으므로 국세기본법 제81조 및 제65조 제1항 제3호의 규정에 의하여 주문과 같이 결정한다.